次世代シーケンサーを用いた細菌16S-rRNAアンプリコンシーケンス解析業務に係る公募について

次世代シーケンサーを用いた細菌16S-rRNAアンプリコンシーケンス解析業務に係る公募について 次世代シーケンサーを用いた細菌16S-rRNAアンプリコンシーケンス解析業務に係る公募について(公告)次のとおり受託者を公募します。 令和８年２月６日香川県環境保健研究センター所 長 中 西 正 光１ 公募に付する事項(1) 委託業務名 次世代シーケンサーを用いた細菌16S-rRNAアンプリコンシーケンス解析業務(2) 委託期間 契約締結日から令和８年３月３１日まで(3) 委託業務の内容 別紙仕様書のとおり２ 応募資格次に掲げる要件を満たす者とします。 (1) 地方自治法施行令(昭和22年政令第16号)第167条の4の規定に該当しない者。 (2) 香川県物品の買入れ等に係る指名停止等措置要領(平成11年香川県告示第787号)に基づく指名停止措置を現に受けていない者。 (3) 会社更生法(平成14年法律第154号)による更生手続開始の申立て又は民事再生法(平成11年法律第225号)による再生手続開始の申立てがなされていない者。 ただし、次に掲げる者は、この要件を満たすものとする。 ① 会社更生法に基づく更生手続開始の決定を受けた者。 ② 民事再生法に基づく再生計画認可の決定(確定したものに限る。)を受けた者。 (4) 香川県税に滞納のない者(香川県税の納税証明書〔未納のない旨の証明〕を提出すること。)ただし、応募意思表明書の提出時点において競争入札参加資格者名簿に登載されている者は提出しなくてよい。 (5) 当該業務遂行に必要なノウハウを有し、かつ、業務の遂行に必要な組織及び人員を有している者。 ３ 応募方法応募意思表明書(様式１)を環境保健研究センターに持参又は郵送(期間内必着)により提出してください。 (受付期間)令和８年２月６日(金)から令和８年２月１３日(金)まで(土･日曜日、祝日を除く。)(受付時間)８：３０～１２：００、１３：００～１７：１５４ 契約の方法(1) 応募意思表明書を提出した者が１者の場合は、単独随意契約の方法により契約を締結します。 (2) 応募意思表明書を提出した者が２者以上ある場合は、競争見積りの方法により契約相手を選定した上、契約を締結します。 ５ 契約書作成の要否要します。 ６ 電子契約の可否可とします。 ※電子契約(契約書を電子ファイルで作成し、双方の押印に代わり、電子契約サービスによる電子署名と電磁的記録が改変されていないことが確認できるタイムスタンプを付与するもの)を行う場合は、県が指定した電子契約サービスを利用します。 ご利用にあたっては、インターネット環境と、契約締結に利用するメールアドレスを用意していただく必要があります。 (2) 電子契約を希望する場合は、「電子契約同意書兼メールアドレス確認書」を入札時又は見積書提出時に電子入札システム又は電子メールにより提出してください。 (3) 電子契約においては、タイムスタンプが付与された日が契約締結日となります。 ７ 応募・照会先〒760-0065 香川県高松市朝日町５丁目３－１０５香川県環境保健研究センター 総務企画課ＴＥＬ：０８７－８２５－０４００ＦＡＸ：０８７－８２５－０４０８ 別 紙仕様書１．件名次世代シーケンサーを用いた細菌16S-rRNAアンプリコンシーケンス解析２．履行期限令和８年３月31日３．概要大豆湯煮廃水処理汚泥中の細菌叢解析４．解析内容１)検体(１)大豆湯煮廃水処理汚泥からの抽出DNAを当方より冷蔵便で送付する。 (２)検体数：12(３)バイオセーフティーレベル(BSL)非該当。 遺伝子組み換えなし。 (４)10ng/µL以上のgDNAを50µL程度送付可能(260nmの吸光度ベースでの定量)。 (５)受領後、受託者がPCR阻害物質の除去(カラム精製)を行う。 ２)1stPCR(１)対象遺伝子領域：16S rRNA V3/V4(２)プライマー： 341'f＊-805r＊341'f primer は、(Hugerth et al.2014)で報告されている改変プライマー。 検体と同時に当方より提供可能。 ３)シーケンス条件(１)illumina社 NextSeq1000またはMiSeqを使用。 (２)リード長およびデータ量は、300bp Paired Endおよび１サンプルあたり３～５万リードペア程度とする。 ４)解析(１)QIIME2(DADAモデル)による系統推定(データベース SILVA)。 (２)可能な限り属レベルまで。 難しいものについては科レベルまででよい。 ５．その他提出物１)委託業務完了報告書：紙媒体２)シーケンスデータ(Fastq file)：電子ファイル３)系統解析結果(エクセルファイルと可視化データ)：電子ファイル